Tobi

O verdadeiro líder da Akatsuki mostrado recentemente no mangá (ao contrário de muitos entendimentos errados) foi Pain, sendo que o mentor por trás da organização foi Madara Uchiha, que foi um dos fundadores da organização, junto de Yahiko. Essa organização tem por meta a coleta de todos os bijuus, criaturas compostas unicamente de chakra Inicialmente o número de componentes era de dez ninjas, porém seu número de integrantes acabou por ser reduzido com a fuga de Orochimaru da organização,e a captura de Hidan, e também pelas mortes de Kakuzu, Deidara, Itachi Uchiha, Kisame Hoshigake, Konan, Nagato e Sasori sendo este último substituído por Tobi.
Cada membro da Akatsuki possui uma bandana de seu vilarejo de origem com um risco transversal feito para simbolizar a deserção e o ódio por sua vila natal, um anel identificando suas posições na organização, um chapéu de palha e uma roupa negra decorada com nuvens vermelhas (simbolizando a chuva de sangue da 3°guerra). Cada anel possui um símbolo diferente
Quando os integrantes saem à campo, trabalham em duplas, geralmente coletando informações e novos Jutsus, mas seu objetivo primário é a captura dos bijuus e hospedeiros, os ditos jinchuurikis. O bijuu possui tanto chakra e poder que o processo de extração é fatal para seu hospedeiro: os integrantes da Akatsuki se reúnem, seja por meio de projeção astral, feita pelo Jutsu Gentoshin no Jutsu, ou pela presença real no local; posicionam-se e executam uma técnica surpreendente, o Genryuu Kyuu Fuujin; com essa técnica o chakra do bijuu é extraído de seu Jinchuuriki e armazenado para uso posterior da organização.
O anel dos integrantes da Akatsuki, um dos símbolos da organização, não pode ser retirado da mão enquanto o portador estiver vivo. Os anéis já existiam antes da organização, e são parte dos requisitos para se tornar um membro. Além de ter que possuir a joia, o aspirante também deve ser notavelmente forte e habilidoso. O décimo (10º) membro ainda não foi substituído oficialmente, visto que o anel de Orochimaru não está sob a guarda da Akatsuki.
Atualmente a Equipe Taka (Falcão) se aliou a Akatsuki, para que assim consigam realizar suas metas, que em muito se cruzam. Porém Suigetsu, Karin, Juugo e Sasuke Uchiha não são oficialmente membros, já que não possuem os anéis.
Um dos supostos líderes (Madara Uchiha/Tobi), após vencer Konan, recebe o poder do Rin'negan, que segundo ele, já pertencia a ele desde o começo e adquiriu uma nova máscara com 3 furos tendo no seu olho esquerdo o poderoso Rin'negan e de seu lado direito o Sharingan.